Hamano Lab

Presentation

（2019年4月以降のみ掲載しています）

　　　　　　

    （口頭発表）

  1. 石原慎也, 岩田通夫, 林広夢, 濱野桃子, 霜古田一優, 木谷晃広, 吹田直政, 山西芳裕, 細胞形態画像から医薬品候補化合物の標的分子を予測する機械学習手法の開発 , 日本薬学会 第144年会, 2024/3/28-31, (優秀発表賞)
  2. 濱野桃子、川崎瞭太、廣瀨昌樹、山西芳裕, シングルセルマルチオミクスデータを用いた生体内リプログラミング誘導転写因子の予測 , 第23回日本再生医療学会総会, 2024/3/21-23
  3. 濱野桃子、川崎瞭太、廣瀨昌樹、江口凌平、岩田通夫、沖真弥、山西芳裕, シングルセルマルチオミクスデータを用いたダイレクトリプログラミング誘導転写因子の予測 , 第46回日本分子生物学会年会, 2023/12/6-8
  4. Shinya Ishihara, Michio Iwata, Hiromu Hayashi, Momoko Hamano, Kazumasa Shimofuruta, Akihiro Kitani, Naomasa Suita, and Yoshihiro Yamanishi, Computational prediction of target molecules of drug candidate compounds from cell morphology images, 情報計算化学生物学会（CBI学会）2023年大会, 2023/10/23-26
  5. Momoko Hamano, Toru Nakamura, Michio Iwata, Ryohei Eguchi, Jun-ichi Takeshita and Yoshihiro Yamanishi, Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations , 第12回生命医薬情報学連合大会, 2023/9/7-9
  6. 濱野桃子、中村透、岩田通夫、江口凌平、竹下潤一、山西芳裕, ダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物組み合わせのin silico予測, 第22回日本再生医療学会総会, 2023/3/23-25
  7. 濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, パイオニア転写因子を考慮したトランスオミクス手法によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第45回日本分子生物学会年会, 2022/11/30-12/2
  8. 濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, TRANSDIRE:パイオニア転写因子を考慮したトランスオミクス手法によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第11回生命医薬情報学連合大会, 2022/9/13-15
  9. 林 広夢, 候 聡志, 戴 哲皓, 藤田 寛奈, 野村 征太郎, 清島 拓樹, 濱野 桃子, 小室 一成, 山西 芳裕, 心筋細胞核およびDNA損傷マーカーの染色画像を用いたVision Transformerによる心不全の治療予後予測, 第11回生命医薬情報学連合大会, 2022/9/13-15
  10. Michio Iwata, Toru Nakamura, Momoko Hamano, Ryohei Eguchi, Jun-ichi Takeshita and Yoshihiro Yamanishi, Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations, 2022 European Conference on Computational Biology, 2022/9/12-21
  11. 濱野桃子、江口凌平、岩田通夫、中村透、山西芳裕, トランスオミクス解析によるダイレクトリプログラミング誘導転写因子の予測, 第21回日本再生医療学会総会, 2022/3/17-19
  12. 清島拓樹、藤田寛奈、候聡志、野村征太郎、濱野桃子、小室一成、山西芳裕, 心筋細胞の核形態画像を用いた機械学習による心不全の診断モデル, 第10回生命医薬情報学連合大会, 2021/9/27-29
  13. 大崎友輔、松本悠、松尾優樹、原口祐里奈、濱野桃子、佐矢野智子、古屋茂樹, Phgdh 遺伝子欠損によるセリン欠乏はマウス線維芽細胞において細胞形態と細胞内小器官の変化を誘発する, 2020年度日本フードファクター学会・日本農芸化学会西日本支部合同大会, 2020/10/31-00
  14. 内海 真、濱野 桃子、江崎 加代子、立川 正憲、古屋 茂樹, 脳特異的セリン合成不全マウスにおいて惹起される神経伝達Caシグナル関連分子の発現変化, 2020年度日本フードファクター学会・日本農芸化学会西日本支部合同大会, 2020/10/31-00
  15. 濱野 桃子， 友永 省三， 小田 裕昭， 加藤 久典， 古屋 茂樹, 細胞外セリン欠乏に応答した肝がん細胞株のアミノ酸代謝及び遺伝子発現制御機構, 日本農芸化学会2020年度大会, 2020/2/29
  16. 内海 真， 濱野 桃子， 古屋 茂樹, 脳特異的セリン合成不全マウスにおいて惹起されるCaシグナル関連分子の脳内発現変化, 日本農芸化学会2020年度大会, 2020/2/29
  17. 濱野桃子, 野村征太郎, 油谷浩幸, 小室一成, 山西芳裕, 一細胞解析による心不全の分子病態メカニズムの解明, 第42回 日本分子生物学会年会, 2019/12/3-6
  18. 大崎友輔， 松尾優樹， 原口祐里奈， 濱野桃子， 佐矢野智子， 古屋茂樹, マウス線維芽細胞においてPhgdh遺伝子欠損によるセリン欠乏はアポトーシス経路を活性化する, 日本農芸化学会 2019 年度 西日本・中四国支部合同大会, 2019/10/31
  19. 濱野桃子, 野村征太郎, 油谷浩幸, 小室一成, 山西芳裕, Identification of a biomarker for disease progression in heart failure using single-cell RNA sequencing data, 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  20. 岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Francois Berenger, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕, Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm", 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  21. 中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕, 低分子化合物によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第8回生命医薬情報学連合大会, 2019/9/9-11
  22. 江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, トランスクリプトーム情報とエピゲノム情報の融合解析によるインシリコ・ダイレクトリプログラミング", 第8回生命医薬情報学連合大会, 2019/9/9-11
  23. 岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Francois Berenger, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕, 新規のTensor-train分解アルゴリズムによる、多様なヒト細胞における薬物応答トランスクリプトームの予測, 第8回生命医薬情報学連合大会, 2019/9/9-11

    （ポスター発表）

  1. 廣瀬昌樹, 濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 山西芳裕, 一細胞レベルのオミックスデータの統合解析によるダイレクトリプログラミング転写因子予測手法の開発, 第46回日本分子生物学会年会, 2023/12/6-8
  2. Ryoku Ito, Momoko Hamano and Yoshihiro Yamanishi, Prediction of small molecules that induce direct reprogramming considering the process of cell conversion at the single-cell level, 第12回生命医薬情報学連合大会, 2023/9/7-9
  3. 古屋茂樹、高鍋莉紗子、中島夢人、吉良早由里、古屋裕美、池上舞、濱野桃子、江崎加代子, 脳特異的L-セリン合成不全マウスのRNA-Seqによる脳内主要領域比較遺伝子発現解析, 第77回日本栄養・食糧学会大会, 2023/5/12-14
  4. 濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, パイオニア転写因子を考慮したトランスオミクス手法によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第45回日本分子生物学会年会, 2022/11/30-12/2
  5. 濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 山西芳裕, 化合物応答トランスクリプトーム解析によるダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物のインシリコ予測, 第44回日本分子生物学会年会, 2021/12/1-3
  6. 濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 山西芳裕, トランスクリプトームデータを用いたダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物の組み合わせ予測, 第10回生命医薬情報学連合大会, 2021/9/27-29
  7. 中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕,, 大規模オミクスデータ解析を介した低分子化合物によるダイレクトリプログラミング, 日本分子生物学会, 2020/12/2-4
  8. 江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 日本分子生物学会, 2020/12/2-4
  9. 大崎友輔、松本悠、松尾優樹、濱野桃子、佐矢野智子、古屋茂樹, Phgdh欠損によるセリン欠乏は線維芽細胞において細胞形態およびミトコンドリアの変化を誘発する, 日本アミノ酸学会第14回学術大会, 2020/10/31-11/1
  10. 松本悠、大崎友輔、松尾優樹、濱野桃子、佐矢野智子、古屋茂樹, Phgdh 欠損によるセリン欠乏は線維芽細胞の insulin/IGF シグナル経路を減弱させる, 日本アミノ酸学会第14回学術大会, 2020/10/31-11/1
  11. 中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕, 低分子化合物によるパスウェイ制御を介したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第9回生命医薬情報学連合大会, 2020/9/1-3
  12. 江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング, 第9回生命医薬情報学連合大会, 2020/9/1-3
  13. 濱野桃子, 野村征太郎, 油谷浩幸, 小室一成, 山西芳裕, 一細胞解析による心不全の分子病態メカニズムの解明, 第42回 日本分子生物学会年会, 2019/12/3-6
  14. 岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Francois Berenger, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕, Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm, 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  15. 江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕, Computational direct reprogramming by integrating genome, transcriptome and epigenome data, 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  16. 中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕, Small Compound-based Direct Reprogramming Using Large-scale Omics Data, 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  17. 濱野桃子, 野村征太郎, 油谷浩幸, 小室一成, 山西芳裕, Identification of a biomarker for disease progression in heart failure using single-cell RNA sequencing data, 情報計算化学生物学会2019年大会, 2019/10/22-24
  18. 濱野桃子, 野村征太郎, 油谷浩幸, 小室一成, 山西芳裕, シングルセルレベルにおける心不全病態ダイナミクスの解明, 第8回生命医薬情報学連合大会, 2019/9/9-11
  19. 大崎友輔, 松尾優樹, 原口祐里奈, 濱野桃子, 佐矢野智子, 古屋茂樹, セリン欠乏により惹起されるアポトーシス経路の解析, 第56回化学関連支部合同九州大会, 2019/6/30

    （招待講演）

  1. Momoko Hamano, Data-driven direct cell reprogramming based on pioneer factors via a trans-omics approach, Rise of diversity in science（熊本大学IRCMS主催シンポジウム）, 2023年9月）
  2. 濱野 桃子，野村 征太郎，小室 一成，山西 芳裕，トランスオミクスアプローチによる一細胞レベルの心不全分子メカニズムの解明（第65回 日本薬学会学術年会関東支部大会, シンポジウム「計算科学が拓く薬学の未来」, 2021年9月）
　　　　

Awards

 　　　　　
  1. 伊藤綠風，第12回生命医薬情報学連合大会 最優秀ポスター賞（2023年9月) (学生の受賞です)
  2. 濱野桃子，第10回生命医薬情報学連合大会 ポスター発表賞（2021年9月）
  3. 濱野桃子，第9回生命医薬情報学連合大会 優秀口頭発表賞（2020年9月）
  4. 濱野桃子，第42回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム 優秀発表賞（2018年8月）
  5. 濱野桃子，第48回 化学関連支部合同九州大会 ポスター賞（2011年7月）
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